El estudio de la estructura y función de los seres vivos requiere del análisis de distintos tipos de secuencias biológicas (ADN, ARN, proteínas...) así como de su interacción. Con el desarrollo y abaratamiento de distintos análisis biológicos, como por ejemplo la secuenciación masiva de ADN, es posible generar cantidades masivas de estas secuencias incluso en organismos no modelo. Para poder utilizar esta información en procesos como el ensamblaje de genomas, alineamiento de ADN y proteínas o análisis de expresión génica, es imprescindible el uso de herramientas bioinformáticas que permitan una manipulación rápida y reproducible de los datos. Este curso pretende introducir el manejo de distintas herramientas bioinformáticas que faciliten la obtención, manipulación y análisis eficaz de secuencias biológicas.

Este curso pretende introducir el manejo de distintas herramientas bioinformáticas que faciliten la obtención, manipulación y análisis eficaz de secuencias biológicas.

- Introducción al S.O. Linux en el análisis de secuencias biológicas: Procesamiento de ficheros de secuencias, usados en análisis bioinformáticos, con Linux; Comandos básicos para la manipulación y análisis de secuencias.
- Introducción al lenguaje de programación Python y su uso en análisis de datos de secuencias: Un primer programa; Control de flujo; Funciones y ficheros; Minería de datos; Biopython.

- Que los estudiantes sepan aplicar los conocimientos adquiridos y su capacidad de resolución de problemas en entornos nuevos o poco conocidos dentro de contextos más amplios (o multidisciplinares) relacionados con su área de estudio.
- Que los estudiantes posean las habilidades de aprendizaje que les permitan continuar estudiando de un modo que habrá de ser en gran medida autodirigido o autónomo.
- Demostrar una buena capacidad de acceder por búsquedas electrónicas en bases de datos a la literatura científico-técnica.
- Comprender y aplicar los modelos y métodos avanzados de análisis cualitativo y cuantitativo en el área de la materia correspondiente.
- Analizar e interpretar los resultados obtenidos con el objeto de obtener conclusiones relevantes a partir de los mismos.
- Comprender el uso básico del lenguaje de programación Phyton y programas de línea de comandos bajo Linux para el análisis y manipulación de secuencias biológicas.
- Actuar según principios de carácter universal que se basan en el valor de la persona y se dirigen a su pleno desarrollo.

- Clases magistrales
- Prácticas de ordenador

- Control de asistencia.

- Exámen tipo test.

- Baxevanis, A. D. and Ouellette, B. F. F., 2005. Bioinformatics: a practical guide to the analysis of genes and proteins. Wiley-Interscience, Hoboken, New Jersey.
- Brown, S. M., 2013. Next-generation DNA sequencing informatics. CSH, Cold Spring Harbor, NY.
- Dardel, F.; Kepes, F. and Hardy, N., 2006. Bioinformatics: genomics and post-genomics. John Wiley & Sons,Hoboken, New Jersey.
- Deonier, R. C.; Tavaré, S. and Waterman, M. S., 2005. Computational genome analysis: an introduction. Springer, New York.
- Hahne, F., 2008. Bioconductor case studies. Springer, New York.
- Rodriguez-Ezpeleta, N.; Hackenberg, M. and Aransay, A. M., 2011. Bioinformatics for high throughput sequencing. Springer, New York, London.

El cursos se desarrollará entre 1 y 8 de julio de 2019.

Horario de 10.00 a 14.00 horas