Actividades formativas de Doctorado de la Universidad de Cádiz
 
5600780-1903

Introducción a la Ecología Molecular

Organiza: Comisión Académica Programa Ciencias y tecnologías Marinas

Inscripción en: https://posgrado.uca.es/doctor
(en este momento no hay plazo abierto para inscripción en este curso)

Coordinación:
Dr. D. ALEJANDRO CENTENO CUADROS
Plazas ofertadas por grupo: 20
Duración: 30 horas
Modalidad: Presencial    Idioma: Español

Lugar de impartición: CASEM
Campus de Puerto Real
Precio de matrícula de este curso: 16.40 euros


Destinatarios
Alumnos de doctorado de EIDEMAR


Descripción general

El curso presenta las principales contribuciones que las técnicas moleculares en general y la genética en particular han aportado al estudio de la ecología, evolución y conservación de la biodiversidad. El curso se caracteriza por su enfoque esencialmente práctico, si bien antes de cada exposición de casos prácticos se explicará la teoría necesaria para comprenderlos.




Objetivos

- Conocer los principales métodos de muestreo y conservación de muestras en los análisis genéticos.
- Conocer los principales marcadores moleculares utilizados en ecología y conservación y sus aplicaciones.
- Aprender a identificar individuos mediante marcadores moleculares. Pros y contras de los métodos no invasivos.
- Cuantificar la diversidad y estructura genéticas de las poblaciones y conocer sus aplicaciones.
- Utilizar los métodos moleculares para la identificación de especies e inferir su historia evolutiva: filogenias y filogeografía.



Contenidos

- Introducción a la Ecología Molecular: ¿qué podemos preguntarnos y cómo podemos responderlo?
- Diseño de muestreo.
- Técnicas y marcadores moleculares: bases genéticas, metodología y criterios de selección (¿cuál escoger? ¿cómo utilizarlo?)
- Introducción a los métodos de muestreo de ADN no invasivo y ADN antiguo.
- La era de la genómica.
- Construcción de genotipos y sus aplicaciones: parentesco, paternidades y éxito reproductor.
- Estima e interpretación de la diversidad genética y su aplicación en Ecología Molecular y Genética de la Conservación.
- Estima e interpretación de la estructura genética y su aplicación en Ecología Molecular y Genética de la Conservación: estimas de flujo génico.
- Uso de marcadores moleculares en taxonomía y conservación. Genealogías intraespecíficas, reconstrucción de la historia evolutiva de las especies e identificación de híbridos.



Competencias básicas y capacidades

- Adquirir habilidades para el trabajo en laboratorio de biología molecular.
- Adquirir habilidades para el análisis de datos moleculares para la identificación y caracterización de individuos, poblaciones y especies.
- Familiarizarse con los distintos marcadores moleculares más utilizados en ecología molecular e identificar los sistemas de estudio en los que se aplican.
- Utilizar genotipos individuales en pruebas forenses y muestreos no invasivos.
- Conocer los fundamentos teóricos de la genética de poblaciones y sus aplicaciones en la genética del paisaje.
- Aprender a evaluar el estado de conservación de las poblaciones/especies basándose en la diversidad y estructura genética.
- Utilizar los marcadores moleculares en taxonomía y conservación.



Metodología

- Clases magistrales.
- Prácticas de ordenador.
- Prácticas de laboratorio (dependiendo del presupuesto asignado al curso se planteará hacer alguna práctica de laboratorio. Podría incrementar el número de horas lectivas del curso).



Sistema de evaluación

- Control de asistencia.

- Examen escrito con preguntas tipo test, desarrollo y casos prácticos.



Bibliografía

- Beaumont M a (2005). Adaptation and speciation: what can F(st) tell us? Trends Ecol Evol 20: 435–40.
- Frankel OH (1974). Genetic conservation: our evolutionary responsibility. Genetics 78: 53–65.
- Frankham R, Ballou JD, Briscoe DA (2002). Introduction to conservation genetics. Cambridge University Press: Cambridge.
- Knowles LL, Maddison WP (2002). Statistical phylogeography. Mol Ecol 11: 2623–35.
- Kohn MH, Murphy WJ, Ostrander E a, Wayne RK (2006). Genomics and conservation genetics. Trends Ecol Evol 21: 629–37.
- Manel S, Schwartz MK, Luikart G, Taberlet P (2003). Landscape genetics: combining landscape ecology and population genetics. Trends Ecol Evol 18: 189–197.
- Petit RJ, Aguinagalde I, de Beaulieu J-L, Bittkau C, Brewer S, Cheddadi R, et al. (2003). Glacial refugia: hotspots but not melting pots of genetic diversity. Science 300: 1563–5.
- Ramón-Laca A, Soriano L, Gleeson D, Godoy JA (2015). A simple and effective method for obtaining mammal DNA from faeces. Wildlife Biol 21: 195–203.
- Soler M, Tinaut Ranera JA (2002). Evolucio?n : la base de la biologi?a (M Soler, Ed.). Proyecto Sur de Ediciones.
- Waples RS, Gaggiotti O (2006). What is a population? An empirical evaluation of some genetic methods for identifying the number of gene pools and their degree of connectivity. Mol Ecol 15: 1419–39.



Información adicional

Horario de 9.30 a 13.30

Se incluyen 3 horas no presenciales.