Actividades formativas de Doctorado de la Universidad de Cádiz
 
8211B02_005

BIOTECNOLOGÍA APLICADA A ORGANISMOS MARINOS

Organiza: Programa Ciencias y Tecnologías Marinas

Inscripción en: https://posgrado.uca.es/doctor
(en este momento no hay plazo abierto para inscripción en este curso)

Coordinación:
Dra. Dª. LAUREANA REBORDINOS GONZALEZ
Plazas ofertadas por grupo: 15
Duración: 50 horas (25 h. presenciales)
Modalidad: Presencial    Idioma: Español

Lugar de impartición: CASEM y Facultad de Ciencias
Campus de Puerto Real
Precio de matrícula de este curso: 27.24 euros


Destinatarios
Alumnos de doctorado de EIDEMAR


Descripción general

El conocimiento del mar pasa necesariamente por la aplicación de una metodología que permita conocer el material hereditario de los seres vivos (ADN) y su expresión (ARN y proteínas). Este estudio debe llevarse a cabo a nivel molecular, cromosómico  y celular.  Además hay que analizarlo tanto a nivel individual, en  cada organismo en el que se estudie,  como  a nivel poblacional.  También debe considerarse la interacción entre organismos, que condicionan en gran medida el destino de las especies acuáticas, tanto en cultivo como en el medio natural. Esta interacción es especialmente relevante cuando hay patógenos implicados.
Por otra parte, el rápido desarrollo de nuevas metodologías y su demostrada utilidad en acuicultura, recursos pesqueros y organismos marinos en general, justifica  la propuesta de este curso en el que se utilizarán como organismos modelo dos especies emblemáticas en acuicultura: dorada y lenguado. Sobre ellas se irán aplicando diversas técnicas de acuerdo con el programa del curso.



Contenidos

- Técnicas de obtención, caracterización y secuenciación de ADN cromosómico y plasmídico: bases moleculares teóricas y actividad práctica.
- Principales marcadores moleculares y técnicas para identificación. Aplicaciones en procariotas y eucariotas.
- Trazabilidad alimentaria. Sesión práctica de identificación mediante secuenciación y analisis in silico de muestras problemas.
- Análisis de fragmentos (microsatélites) mediante PCR multiplex.
- Genotipado y asignación de parentesco.
- Localización de genes utilizando clones BAC (bacterial artificial chromosomes) mediante FISH (fluoresecence in situ hybridization) simple, doble y múltiple: teoría y práctica.
- Mapas genéticos integrados mediante la utilización de BACs y cromosomas aislados por microdisección láser.
- La RT-qPCR: Conceptos generales.
- Optimización de la RT-qPCR: Primers, temperatura de anillamiento, formación de dímeros, Eficiencia de la reacción.
- Prácticas: desarrollo de recta de calibrado, cálculo de la eficiencia de la amplificación  y cuantificación de distintas muestras.
- Análisis funcional de cDNA mediante transfección transitoria. Metodología de la transfección química. Uso de genes reporteros: EGFP y DsRed. Teoría y práctica.
-Técnicas inmunocitoquímicas y de hibridación in situ: bases teóricas.
- Localización mediante técnicas de inmunofluorescencia de células neurosecretoras en el cerebro y la hipófisis de peces: marcajes simples y dobles marcajes. Observación al microscopio de fluorescencia: actividad práctica.
- Microdisección láser de células inmunomarcadas: actividad práctica.



Competencias básicas y capacidades

- Adquirir habilidad para el trabajo en laboratorio de biología molecular
- Aprender las bases teóricas y la metodología de obtención de ADN, clonación, secuenciación y caracterización bioinformática de secuencias
- Familiarizarse con el análisis de microsatélites para análisis de parentesco
 - Conocer las principales técnicas moleculares de identificación de especies tanto en procariotas y en eucariotas.
 - Identificar los principales metodologías en trazabilidad alimentaria y de poblaciones
- Conocer los fundamentos de citogenética molecular aplicados a la localización cromosómica de genes y realización de mapas genéticos
- Aprender a realizar e interpretar mapas genéticos integrados
- Conocer la metodología de la transfección química transitoria, así como el análisis y caracterización de los transformantes
- Aprender el uso la técnica de la RT-qPCR para el análisis de la expresión génica y su utilización en el análisis de los datos obtenidos de la RT-qPCR
- Conocer los fundamentos teóricos de las técnicas morfofuncionales para detectar péptidos y ARN mensajeros en secciones de tejidos biológicos, y  desarrollar destrezas prácticas en el uso de técnicas inmunohistoquímicas.



Metodología

- Clases magistrales.

- Prácticas en laboratorio.



Sistema de evaluación

- Control de asistencia.

- Exámen tipo test.



Programación (21-05-2018 a 01-06-2018)
21-05-2018 a 21-05-2018 10.00-13.00 CASEM

Laurerana Rebordinos

Técnicas moleculares de obtención y clonación de ADN. Obtención de BACs. Teoría y práctica

22-05-2018 a 22-05-2018 10.00-14.00 CASEM

Laureana Rebordinos

Análisis de transformantes. Microdisección láser de cromosomas. FISH I. Prácticas

23-05-2018 a 23-05-2018 10.00-13.00 CASEM

Laureana Rebordinos

Obtención de mapas genéticos integrados. Análisis microscópico FISH. Teoría y práctica

24-05-2018 a 24-04-2018 9.00-14.00

José Antonio Muñoz Cueto

 

Técnicas inmunohistoquímicas y de hibridación in situ (teoría). Técnicas de inmunofluorescencia I (prácticas)

25-05-2018 a 25-05-2018 10.00-14.00 CASEM

José Antonio Muñoz Cueto

Técnicas de inmunofluorescencia II (prácticas). Microdisección de captura láser de células inmunomarcadas (prácticas).

28-05-2018 a 28-05-2018 9.00-14.00 CASEM

Carlos Pendón Menéndez

Transfección celular: Conceptos básicos. Ensayo de transfección transitoria.

29-05-2018 a 29-05-2018 10.00-14.00 CASEM

Carlos Pendón Menéndez

RT-qPCR: conceptos básicos. parámetros a optimizar. Diseño experimental. Realización de una recta de calibrado y cuantificación de una muestra.

30-05-2018 a 30-05-2018 9.00-14.00 Facuultad de Ciencias

Antonio Astola González

Obtención y caracterización del ADN. Sesión práctica.

31-05-2018 a 31-05-2018 9.00-14.00 Facultad de Ciencias

Antonio Astola González

Secuenciación de ADN. Microsatélites. Análisis de fragmentos y asignación de parentesco. Sesión práctica.

01-06-2018 a 01-06-2018 9.00-11.00 Facultad de Ciencias

Antonio Astola González

Trazabilidad de alimentos.

01-06-2018 a 01-06-2018 11.00-13.00 CASEM

Laureana Rebordinos

Identificación de especies.

01-06-2018 a 01-06-2018 15.00-18.00 Facultad de Ciencias

Carlos Pendón Meléndez

Observación celular para análisis de expresión génica. Captura y análisis de imágenes.