El estudio de la estructura y función de los seres vivos requiere del análisis de distintos tipo de secuencias biológicas (ADN, ARN, proteínas...) así como de su interacción. Con el desarrollo y abaratamiento de distintos análisis biológicos, como por ejemplo la secuenciación masiva de ADN, es posible generar cantidades masivas de estas secuencias incluso en organismos no modelo. Para poder utilizar esta información en procesos como el ensamblaje de genomas, alineamiento de ADN y proteínas o análisis de expresión génica, es imprescindible el uso de herramientas bioinformáticas que permitan una manipulación rápida y reproducible de los datos.

Este curso pretende introducir el manejo de distintas herramientas bioinformáticas que faciliten la obtención, manipulación y análisis eficaz de secuencias biológicas, así como una introducción al sistema operativo Linux para la ejecución de pipelines bioinformáticos y al lenguaje de programación python, ampliamente extendidos en esto tipo de estudios.

Día 1, lunes 13 de julio (10-14h):

· Introducción teórica al análisis de secuencias y datos de NGS (2h)

· Análisis de secuencias biológicas con herramientas de Linux Linux (2h).

Día 2, martes 14 de julio (10-14h):

· Análisis de secuencias biológicas con herramientas de Linux (4h).

Día 3, miércoles 15 de julio (10-14h):

· Análisis de secuencias biológicas con herramientas de Linux Linux (2h).

· Análisis de datos de secuencias con el lenguaje de programación Python (2h).

Día 4, jueves 16 de julio (10-14h)

· Análisis de datos de secuencias con el lenguaje de programación Python (4h).

Día 5, viernes 17 de julio (10-14h)

Análisis de datos de secuencias con el lenguaje de programación Python (4h).

Día 6, lunes 20 de julio (10-14h).

Análisis de secuencias biológicas con herramientas de Linux (4h).

Día 7, martes 21 de julio (10-11h).

Repaso, preguntas y tutoría final (1h).